بررسی تنوع پروتئینی ژنوتیپ‌های زیتون (.Olea europaea L) از طریق الکتروفورز پروتئینهای ذخیرهای دانه | ||
| دوفصلنامه فنآوری تولیدات گیاهی | ||
| مقاله 16، دوره 8، شماره 2، آذر 1395، صفحه 215-221 اصل مقاله (513.72 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله علمی-پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22084/ppt.2016.1866 | ||
| نویسندگان | ||
| نصیبه شایگان1؛ علیرضا قنبری* 2؛ ستار طهماسبی انفرادی3 | ||
| 1دانشجوی کارشناسی‌ارشد، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شاهد، تهران، ایران | ||
| 2دانشیار، گروه علوم باغبانی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل، ایران | ||
| 3استادیار موسسه ملی مهندسی ژنتیک و بیوتکنولوژی، تهران، ایران | ||
| چکیده | ||
| ذخایر توارثی گیاهی و حفاظت از آنها در امر به‌نژادی از اهمیت ویژه‌ای برخوردار است. از نیازهای اساسی توسعه کشت زیتون در کشور، شناسایی و معرفی ارقام سازگار با اقلیم‌های مناطق مختلف می‌باشد. ایران دارای تنوع زیادی در ژنوتیپ‌های زیتون می‌باشد و معرفی و شناخت این تنوع ژنتیکی می‌تواند به‌عنوان راهکاری در جهت توسعه گونه‌ها قرار گیرد. این پژوهش به‌منظور بررسی تنوع پروتئینی 23 ژنوتیپ زیتون، الگوهای الکتروفورتیک پروتئینهای ذخیرهای دانه انجام شد. نتایج الکتروفورز پروتئینهای استخراجی، حضور 15 نوار را بر مبنـای حرکـت نسبی روی ژل آشکار ساخت و سه گروه پلی‌پپـتیدی که شامل شـش باند تکرارپذیر به‌صـورت {P1 (21 K Da), P2 (25 K Da), P3 (28 K Da), P4 (31 K Da), P5 (35 K Da), P6 (45 K Da)} در همه ژنوتیپها دیده شد و تنها نه باند از آنها در میان ژنوتیپها چندشکلی نشان دادند. تنوع قابل ملاحظه‌ای در الگوی نه باند پروتئینهای مورد بررسی بین ژنوتیپها مشاهده شد. برش دندروگرام حاصل از تجزیهی خوشهای براساس شکلهای مختلف پروتئینی ژنوتیپها را در سه خوشه گروهبندی کرد. خوشه اول شامل یک ژنوتیپ، خوشه دوم دو ژنوتیپ و بیست ژنوتیپ در خوشه سوم قرار گرفتند. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| تجزیهی خوشهای؛ ذخایر توارثی؛ تنوع ژنتیکی؛ پلی‌پپتید؛ دندروگرام | ||
| موضوعات | ||
| بیوتکنولوژی درختان میوه (تنوع ژنتیکی با نشانگرهای مولکولی) | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Investigation of Protein Diversity of Olive (Olea europaea L.) Genotypes Through Electrophoresis of Seed Storage Proteins | ||
| نویسندگان [English] | ||
| Nasibeh Shaigan1؛ Alireza Ghanbari2؛ Satar Tahmasebi Enferadi3 | ||
| 1M.Sc. Student, Department of Biotechnology, Faculty of Agriculture, University of Shahed, Tehran, Iran | ||
| 2Associate Professor, Department of Horticultural sciences, Faculty of Agriculture and Natural Resources, University of Mohaghegh Ardabili, Ardabil, Iran | ||
| 3Assistant Professor, National Institute of Genetic Engineering and Biotechnology, Tehran, Iran | ||
| چکیده [English] | ||
| Botanical hereditary reserves have special importance in racial direction of plants and preserving them is very important in national and international viewpoint. Recognizing and introducing suitable species for different climates are among essential needs to develop olive cultivation in Iran. There are various olive genotypes in Iran that recognizing and introducing such variety can accelerate genetic basis development of these species. The current study has been performed in order to inspect protein diversity of 23 olive genotypes from the viewpoint of electrophoresis patterns of seed storage proteins. The electrophoresis results of extracted proteins revealed the existence of 15 strips according to proportional movement on gel that three poly-peptide groups have been noticed which had 6 repeatable strips of {P1 (21 KDa), P2 (25 KDa), P3 (28 KDa), P4 (31 KDa), P5 (35 KDa), P6 (45 KDa)} was observed in all genotypes. There were only 9 polymorphism strips among genotypes. The considerable diversity was seen in pattern of 9 bands of protein which were studied. Cluster analysis profile of proteins regrouped them into three clusters included one, two and twenty genotypes in each cluster. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Cluster analysis, Germplasm, Genetic diversity, Polypeptide, Dendrogram | ||
| مراجع | ||
|
عبدمیشانی، س. و شاه‌نجات بوشهری، ع. ا. 1390. اصلاح نباتات تکمیلی (دو جلدی)، انتشارت دانشگاه تهران، 352 صفحه. Criley, R. A., Roh, M. S., Kikuchi, M. and Manshardt, R. M. 2008. A comparison of Gardenia augusta cultivars using isozymes and RAPD markers. Acta Horticulturae, 766: 461-468. Dvoracek, V., Curn, V. and Moudry, J. 2003. Suitability of oat-seed storage-protein markers for identification of cultivars in grain and flour samples. Plant, Soil and Environment, 49: 486-491. Ehsanpour, A. A., Shojaie, B. and Rostami, F. 2010. Using protein markers of embryo and seed storage proteins in identification of four pistachio cultivars. Taxonomy and Biosystematics, 3: 1-10. Fufa, H., Baenziger, P. S., Beecher, B. S., Dweikat, I., Graybosch, R. A. and Eskridge, K. M. 2005. Comparison of phenotypic and molecular marker-based classifications of hard red winter wheat cultivars. Euphytica, 145: 133-146. Iqbal, S. H., Ghafoor, A. and Ayub, N. 2005. Relationship between SDS-PAGE markers and Ascochyta blight in Chickpea. Pakistan Journal of Botany, 37: 87-96. Javid, A., Ghafoor, A. and Anwar, R. 2004. Seed storage protein electrophoresis in ground nut for evaluating genetic diversity. Pakistan Journal of Botany, 36: 25-29. Kingsnorth, C. S., Asher, M. J. C., Keane, G. J. P., Chwarszczynska, D. M., Luterbacher, M. C. and Mutasa-Göttgens, E. S. 2003. Development of a recombinant antibody ELISA test for the detection of Polymyxa betae and its use in resistance screening. Plant Pathology, 52: 673-680. Krishnan, H. B. and Sleper, D. A. 1997. Identification of tall fescue cultivar by Sodium Dodecyl Sulfate Polyacrylamide gel electrophoresis of proteins. Crop Science, 37: 215-219. Kruse, M., Koenig, R., Hoffmann, A., Kaufmann, A., Commandeur, U. and Solovyev, A. G. 1994. Restriction fragment length polymorphism analysis of reverse transcription-PCR products reveals the existence of two major strain groups of Beet necrotic yellow vein virus. Journal of General Virology, 75: 1835-1842. Laemmli, U. K. 1997. Cleavage of structural protein during the assembly of the head of bacteriophage T4. Nature, 277: 680-685. Magni, C., Scarafoni, A., Herndl, A., Sessa, F., Prinsi, B., Espen, L. and Duranti, M. 2007. Combined 2-D electrophoretic approaches for the study of white lupin mature seed storage proteome. Phytochemistry, 68: 997-1007. Mutasa-Göttgens, E. S., Chwarszczynska, D., Halsey, K. and Asher, M. J. C. 2000. Specific polyclonal antibodies for the obligate plant parasite Polymyxa–a targeted recombinant DNA approach. Plant Pathology, 49: 276-287. Radic, H. 1998. Characterization of Spelt (Triticum spelta) forms by electrophoretic analyses of seed storage proteins. Comparative analyses of spelt and central European winter wheat cultivars by SDS-PAGE and A-PAGE. Theoretical and Applied Genetics, 91: 1340-1346. TahmasebiEnferadi, S., Gomez-Sanchez, D., Baldini, M. and Vannozzi, G. P. 1998. Effect of Sclerotinia sclerotiorum (Lib) de Bary culture filtrate on sunflower characters, oxalic acid content and shikimate dehydrogenase activity. AGRIS, 28: 81-96. Valizadeh, M. 2001. Seed storage protein profile of grain legumes grown in Iran, using SDS-PAGE. Journal of Agricultural Science Technology, 3: 287-292. Wang, W., De-Dios-Alche J. and Rodriguez-Garcia, M. I. 2001. Characterization of seed storage proteins and their synthesis during seed development in Olea europaea. International Journal of Developmental Biology, 45: 63-64. Wang, W., De-Dios-Alche, J. and Rodriguez-Garcia, M. I. 2007. Characterization of olive seed storage proteins. Acta Physiologiae Plantarum, 29: 439-444. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 931 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 686 |
||